MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9 plasmid pCIS6

Total Repeats: 856

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019436	TAT	2	6	6	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075269
2	NC_019436	TGAA	2	8	41	48	50 %	25 %	25 %	0 %	414075269
3	NC_019436	ATA	2	6	74	79	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075269
4	NC_019436	ATA	2	6	173	178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075269
5	NC_019436	ATCT	2	8	181	188	25 %	50 %	0 %	25 %	414075269
6	NC_019436	A	7	7	192	198	100 %	0 %	0 %	0 %	414075269
7	NC_019436	ATT	2	6	201	206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075269
8	NC_019436	T	7	7	210	216	0 %	100 %	0 %	0 %	414075269
9	NC_019436	AAG	2	6	251	256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075269
10	NC_019436	T	7	7	282	288	0 %	100 %	0 %	0 %	414075269
11	NC_019436	AGA	2	6	297	302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075269
12	NC_019436	A	7	7	302	308	100 %	0 %	0 %	0 %	414075269
13	NC_019436	ATG	3	9	368	376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075269
14	NC_019436	TAT	2	6	399	404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075269
15	NC_019436	TGAT	2	8	413	420	25 %	50 %	25 %	0 %	414075269
16	NC_019436	TCTTA	2	10	483	492	20 %	60 %	0 %	20 %	414075269
17	NC_019436	A	6	6	669	674	100 %	0 %	0 %	0 %	414075269
18	NC_019436	AGA	2	6	681	686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075269
19	NC_019436	A	6	6	730	735	100 %	0 %	0 %	0 %	414075269
20	NC_019436	GAA	2	6	771	776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075269
21	NC_019436	GAT	2	6	787	792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075269
22	NC_019436	TTA	2	6	859	864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075269
23	NC_019436	CTA	2	6	898	903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075269
24	NC_019436	AGA	2	6	965	970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075269
25	NC_019436	AAG	2	6	1055	1060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075269
26	NC_019436	A	6	6	1093	1098	100 %	0 %	0 %	0 %	414075269
27	NC_019436	CTAC	2	8	1114	1121	25 %	25 %	0 %	50 %	414075269
28	NC_019436	TGAG	2	8	1144	1151	25 %	25 %	50 %	0 %	414075269
29	NC_019436	GAA	2	6	1224	1229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075270
30	NC_019436	TAG	2	6	1279	1284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075270
31	NC_019436	AT	3	6	1298	1303	50 %	50 %	0 %	0 %	414075270
32	NC_019436	GTT	2	6	1304	1309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414075270
33	NC_019436	ACA	2	6	1313	1318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414075270
34	NC_019436	AAC	2	6	1408	1413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414075270
35	NC_019436	CAA	3	9	1485	1493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414075270
36	NC_019436	A	6	6	1512	1517	100 %	0 %	0 %	0 %	414075270
37	NC_019436	AGA	2	6	1523	1528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075270
38	NC_019436	AGG	2	6	1573	1578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414075270
39	NC_019436	A	6	6	1581	1586	100 %	0 %	0 %	0 %	414075270
40	NC_019436	AATC	2	8	1590	1597	50 %	25 %	0 %	25 %	414075270
41	NC_019436	GAA	2	6	1602	1607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075270
42	NC_019436	ATAAA	2	10	1645	1654	80 %	20 %	0 %	0 %	414075270
43	NC_019436	AAT	2	6	1671	1676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075270
44	NC_019436	A	6	6	1686	1691	100 %	0 %	0 %	0 %	414075270
45	NC_019436	ACAG	2	8	1826	1833	50 %	0 %	25 %	25 %	414075271
46	NC_019436	CAAGA	2	10	1878	1887	60 %	0 %	20 %	20 %	414075271
47	NC_019436	GGA	2	6	1893	1898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414075271
48	NC_019436	AGA	2	6	1921	1926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075271
49	NC_019436	A	6	6	1943	1948	100 %	0 %	0 %	0 %	414075271
50	NC_019436	AATA	2	8	1970	1977	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019436	TAT	2	6	2008	2013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019436	ATT	2	6	2164	2169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019436	T	6	6	2168	2173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019436	A	6	6	2181	2186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019436	T	6	6	2192	2197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019436	A	6	6	2210	2215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019436	T	6	6	2258	2263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019436	TCA	2	6	2273	2278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_019436	TCA	3	9	2306	2314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075272
60	NC_019436	T	7	7	2339	2345	0 %	100 %	0 %	0 %	414075272
61	NC_019436	TA	3	6	2403	2408	50 %	50 %	0 %	0 %	414075272
62	NC_019436	ATC	2	6	2422	2427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075272
63	NC_019436	TGT	2	6	2491	2496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414075272
64	NC_019436	TGT	2	6	2540	2545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414075272
65	NC_019436	GTTTGA	2	12	2646	2657	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	414075272
66	NC_019436	CTTTGT	2	12	2693	2704	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	414075272
67	NC_019436	T	7	7	2754	2760	0 %	100 %	0 %	0 %	414075272
68	NC_019436	TAA	2	6	2790	2795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075272
69	NC_019436	TTTCTT	2	12	2943	2954	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	414075272
70	NC_019436	CTTT	2	8	2972	2979	0 %	75 %	0 %	25 %	414075272
71	NC_019436	TTTC	2	8	3026	3033	0 %	75 %	0 %	25 %	414075272
72	NC_019436	T	6	6	3071	3076	0 %	100 %	0 %	0 %	414075272
73	NC_019436	T	7	7	3093	3099	0 %	100 %	0 %	0 %	414075272
74	NC_019436	T	6	6	3136	3141	0 %	100 %	0 %	0 %	414075272
75	NC_019436	GTC	2	6	3145	3150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414075272
76	NC_019436	GTTT	2	8	3225	3232	0 %	75 %	25 %	0 %	414075272
77	NC_019436	AAT	2	6	3273	3278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075272
78	NC_019436	GGAC	2	8	3308	3315	25 %	0 %	50 %	25 %	414075272
79	NC_019436	AAT	2	6	3316	3321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075272
80	NC_019436	TTTC	2	8	3357	3364	0 %	75 %	0 %	25 %	414075272
81	NC_019436	TGA	2	6	3389	3394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075272
82	NC_019436	ATTT	2	8	3396	3403	25 %	75 %	0 %	0 %	414075272
83	NC_019436	AAT	2	6	3472	3477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075272
84	NC_019436	ATC	2	6	3553	3558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075272
85	NC_019436	T	7	7	3599	3605	0 %	100 %	0 %	0 %	414075272
86	NC_019436	T	6	6	3614	3619	0 %	100 %	0 %	0 %	414075272
87	NC_019436	TCA	2	6	3653	3658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075272
88	NC_019436	TGAA	2	8	3664	3671	50 %	25 %	25 %	0 %	414075272
89	NC_019436	T	6	6	3714	3719	0 %	100 %	0 %	0 %	414075272
90	NC_019436	TCA	2	6	3726	3731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075272
91	NC_019436	GAA	2	6	3761	3766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075272
92	NC_019436	CTT	2	6	3842	3847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414075273
93	NC_019436	T	6	6	3851	3856	0 %	100 %	0 %	0 %	414075273
94	NC_019436	ATT	2	6	3909	3914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075273
95	NC_019436	TGAT	2	8	3943	3950	25 %	50 %	25 %	0 %	414075273
96	NC_019436	GAA	2	6	3985	3990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075273
97	NC_019436	ATA	2	6	4000	4005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075273
98	NC_019436	A	6	6	4031	4036	100 %	0 %	0 %	0 %	414075273
99	NC_019436	ATT	2	6	4077	4082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075273
100	NC_019436	TTTC	2	8	4091	4098	0 %	75 %	0 %	25 %	414075273
101	NC_019436	ATC	2	6	4099	4104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075273
102	NC_019436	T	6	6	4143	4148	0 %	100 %	0 %	0 %	414075273
103	NC_019436	TC	3	6	4158	4163	0 %	50 %	0 %	50 %	414075273
104	NC_019436	ATT	2	6	4174	4179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075273
105	NC_019436	TCAC	2	8	4295	4302	25 %	25 %	0 %	50 %	414075273
106	NC_019436	ATTTT	2	10	4320	4329	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019436	ATTTTT	2	12	4348	4359	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019436	GGT	2	6	4360	4365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019436	A	7	7	4387	4393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019436	AC	3	6	4449	4454	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_019436	T	7	7	4493	4499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019436	ATT	2	6	4511	4516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019436	TTC	2	6	4520	4525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_019436	TCT	2	6	4560	4565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_019436	T	7	7	4584	4590	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019436	ATTT	2	8	4601	4608	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019436	TCAT	2	8	4685	4692	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_019436	T	6	6	4728	4733	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019436	T	8	8	4751	4758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019436	TTCT	2	8	4786	4793	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_019436	TCATTG	2	12	4795	4806	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_019436	T	6	6	4808	4813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019436	T	6	6	4852	4857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019436	TAT	2	6	4923	4928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019436	A	6	6	4984	4989	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019436	A	6	6	4991	4996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019436	AT	3	6	5038	5043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019436	CCT	2	6	5065	5070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_019436	CTCAA	2	10	5099	5108	40 %	20 %	0 %	40 %	414075274
130	NC_019436	CAA	3	9	5125	5133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414075274
131	NC_019436	A	6	6	5155	5160	100 %	0 %	0 %	0 %	414075274
132	NC_019436	ATA	2	6	5167	5172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075274
133	NC_019436	TGACAA	2	12	5243	5254	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	414075274
134	NC_019436	ATA	2	6	5308	5313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075274
135	NC_019436	GTT	2	6	5392	5397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414075274
136	NC_019436	TAA	2	6	5424	5429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075274
137	NC_019436	AC	3	6	5432	5437	50 %	0 %	0 %	50 %	414075274
138	NC_019436	ATAA	2	8	5454	5461	75 %	25 %	0 %	0 %	414075274
139	NC_019436	AAC	2	6	5494	5499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414075274
140	NC_019436	TAA	2	6	5514	5519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075274
141	NC_019436	TCG	2	6	5612	5617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414075274
142	NC_019436	CTG	2	6	5647	5652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414075274
143	NC_019436	AT	3	6	5662	5667	50 %	50 %	0 %	0 %	414075274
144	NC_019436	TGA	2	6	5696	5701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019436	CT	4	8	5747	5754	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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276	NC_019436	TTG	2	6	11992	11997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414075281
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278	NC_019436	T	7	7	12034	12040	0 %	100 %	0 %	0 %	414075281
279	NC_019436	ATT	2	6	12050	12055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075281
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281	NC_019436	TTA	2	6	12179	12184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_019436	GA	3	6	12213	12218	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
283	NC_019436	GAA	2	6	12228	12233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
284	NC_019436	ATT	2	6	12250	12255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075282
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295	NC_019436	TTTA	2	8	13249	13256	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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408	NC_019436	A	6	6	18028	18033	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
409	NC_019436	T	7	7	18110	18116	0 %	100 %	0 %	0 %	414075286
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413	NC_019436	TTC	2	6	18226	18231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414075286
414	NC_019436	GTA	2	6	18253	18258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075286
415	NC_019436	TC	3	6	18371	18376	0 %	50 %	0 %	50 %	414075286
416	NC_019436	ATTG	2	8	18467	18474	25 %	50 %	25 %	0 %	414075286
417	NC_019436	GTT	2	6	18483	18488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414075286
418	NC_019436	TAAA	2	8	18519	18526	75 %	25 %	0 %	0 %	414075286
419	NC_019436	ATA	2	6	18571	18576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075286
420	NC_019436	TGT	2	6	18595	18600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414075286
421	NC_019436	T	6	6	18603	18608	0 %	100 %	0 %	0 %	414075286
422	NC_019436	ATTT	2	8	18642	18649	25 %	75 %	0 %	0 %	414075286
423	NC_019436	CTT	2	6	18730	18735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414075286
424	NC_019436	CTT	2	6	18751	18756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414075286
425	NC_019436	ATTT	2	8	18842	18849	25 %	75 %	0 %	0 %	414075286
426	NC_019436	AAT	3	9	18894	18902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
427	NC_019436	CGATG	2	10	19113	19122	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
428	NC_019436	T	6	6	19131	19136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
429	NC_019436	CT	3	6	19145	19150	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
430	NC_019436	GTT	2	6	19261	19266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
431	NC_019436	TTTC	2	8	19286	19293	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
432	NC_019436	AAT	2	6	19304	19309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
433	NC_019436	ATAA	2	8	19436	19443	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
434	NC_019436	T	7	7	19649	19655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
435	NC_019436	AAGA	2	8	19672	19679	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
436	NC_019436	TCT	2	6	19692	19697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
437	NC_019436	GTA	2	6	19823	19828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
438	NC_019436	TATTT	2	10	19866	19875	20 %	80 %	0 %	0 %	414075287
439	NC_019436	CAAA	2	8	19893	19900	75 %	0 %	0 %	25 %	414075287
440	NC_019436	AAT	2	6	19949	19954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075287
441	NC_019436	TTC	2	6	20011	20016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414075287
442	NC_019436	TGTC	2	8	20043	20050	0 %	50 %	25 %	25 %	414075287
443	NC_019436	GCA	2	6	20120	20125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414075287
444	NC_019436	GCT	2	6	20153	20158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414075287
445	NC_019436	CAGA	2	8	20235	20242	50 %	0 %	25 %	25 %	414075287
446	NC_019436	TTA	2	6	20267	20272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075287
447	NC_019436	ATC	2	6	20287	20292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075287
448	NC_019436	GTAA	2	8	20302	20309	50 %	25 %	25 %	0 %	414075287
449	NC_019436	CAAGTC	2	12	20421	20432	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	414075287
450	NC_019436	CAG	2	6	20433	20438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414075287
451	NC_019436	T	6	6	20491	20496	0 %	100 %	0 %	0 %	414075287
452	NC_019436	CTT	2	6	20499	20504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414075287
453	NC_019436	TATT	2	8	20505	20512	25 %	75 %	0 %	0 %	414075287
454	NC_019436	GAAC	2	8	20588	20595	50 %	0 %	25 %	25 %	414075287
455	NC_019436	TCA	3	9	20612	20620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075287
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457	NC_019436	AAT	2	6	20716	20721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075287
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461	NC_019436	TTTGC	2	10	20915	20924	0 %	60 %	20 %	20 %	414075287
462	NC_019436	T	6	6	20969	20974	0 %	100 %	0 %	0 %	414075287
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469	NC_019436	AACT	2	8	21246	21253	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
470	NC_019436	TAT	2	6	21254	21259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
471	NC_019436	T	6	6	21295	21300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
472	NC_019436	TCA	2	6	21312	21317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
473	NC_019436	ATT	2	6	21321	21326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
474	NC_019436	CAA	2	6	21401	21406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
475	NC_019436	TGC	2	6	21423	21428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
476	NC_019436	CTT	2	6	21437	21442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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478	NC_019436	CA	3	6	21519	21524	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
479	NC_019436	TGA	2	6	21629	21634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
480	NC_019436	TCC	2	6	21664	21669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
481	NC_019436	TAT	2	6	21731	21736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
482	NC_019436	CAT	2	6	21741	21746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
483	NC_019436	ACC	2	6	21759	21764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
484	NC_019436	ACG	2	6	21950	21955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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487	NC_019436	TC	3	6	22111	22116	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
488	NC_019436	CTG	2	6	22164	22169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
489	NC_019436	CGT	2	6	22183	22188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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498	NC_019436	T	9	9	22429	22437	0 %	100 %	0 %	0 %	414075288
499	NC_019436	GTT	2	6	22453	22458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414075288
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